Bioinformática, bioestadística y sistemas de información
Deskribapen orokorra
IIS Biobizkaia-ko Bioinformatika, Bioestatistika eta Informatika eta Informazio Sistemen Plataformak diziplina anitzeko laguntza zientifiko eta teknologikoa eskaintzen die institutuko ikerketa taldeei, datu biomediko konplexuen kudeaketa, analisia eta interpretazioa erraztuz. Bere helburu nagusia ikerketa bikaina sustatzea da, analisi konputazionaleko tresna aurreratuen, aholkularitza metodologikoaren eta proiektu bakoitzaren beharretara egokitutako IT irtenbideen bidez.
Plataforma honek hiru arlo osagarritan (bioinformatika, bioestatistika eta informazio sistemak) ezagutza espezializatua integratzen du, ikerketa biomediko modernoak planteatzen dituen erronkei ikuspegi integrala emanez. Lankidetza-ikuspegi baten bidez, datuen kudeaketa eraginkorra, kalitate-analisia eta berrikuntza teknologikoa sustatzen ditu IIS Biobizkaian.
Jarduerak eta zerbitzuak
Hauek dira plataformak egiten dituen jarduerak eta eskaintzen dituen zerbitzuak:
Bioinformatika
- Geen-adierazpenaren analisia.
- Zelula bakarreko analisia.
- Aldaeraren deiak, oharrak eta lehentasunak ematea.
- GWAS azterketa.
- Epigenetikaren analisia.
- Proteomika eta metabolomika analisia.
- Datuen integrazioa eta sistemen biologia.
Bioestatistika
- Datu-baseen diseinuan lankidetza.
- Estadistika-planak sortzea, diseinua egokitzeko estrategia eta tarteko analisia egitea eta, oro har, proiektuaren eraginkortasuna optimizatzeko tresnak aplikatzea.
- Arazketa, datuen tratamendua eta analisi estatistiko planen diseinua. Analisi estatistikoak eta emaitzen interpretazioa garatuko du.
- Laginaren tamainaren kalkulua.
- Ausazko zerrendak sortzea.
Informatika eta informazio sistemak
- Institutuaren informazio-egituraren diseinua eta garapena eta beharrezko softwarea hautatzea. Institutuaren webgunearen diseinua, garapena eta mantentze-lanak.
- Institutuaren webguneko edukiak berrikustea eta eguneratzea, beti ere egileekin harremanetan jarrita.
- Linux eta Windows sistema eragileen kudeaketa. Bisitatutako ikertzaileen edozein sarbide informatikoen kudeaketa bere ordenagailuetan eta/edo Biobizkaia Institutuko ordenagailuetan, Interneterako sarbidea, posta elektronikoa, baita inprimatze/eskaneatzeko zerbitzuak ere.
- Aplikazio eta ekipamendu informatikoen aholkularitza teknikoa: eskaintzak eskatzea, txostenak egitea eta hautaketa-proposamena inplikatutako beste eragileekin elkarlanean.
- Ekipo informatikoen eta aplikazioen konfigurazioa: ekipo/aplikazio informatiko berriak konfiguratu eta instalatu.
- Erabiltzaileen gorabeherak kudeatzea eta zentroko zerbitzu informatikoekin erlazionatzea.
- Datuak biltzeko fitxak diseinatzea (papera).
- Datu-basearen diseinua: datu-basearen diseinu-faseari buruzko aholkularitza (aldagaien hautaketa eta kodeketa, datuen egituraketa eta erlazioak, datuak kudeatzeko softwarea hautatzea, etab.).
- Tokiko datu-base oso baten garapena: ustiaketa, kontsulta, arazketa, kalitate kontrola, etab. funtzionalitateak ezartzea.
- Ustiaketa eta analisirako datuak prestatzea: kontsulta, baliozkotze, arazketa eta estatistika programetara esportatzeko prozesuak.
- Proiektuen Bulego Teknikoa: kanpoko enpresek garatutako proiektuetarako aholkularitza teknikoa eta elkarrizketa (beharren identifikazioa, exekuzioaren jarraipena, etab.).
Azpiegiturak
Gaur egun, Bioinformatika, Bioestatistika eta Informazio Sistemen Plataformak (Bio2SI) azpiegitura hau du:
High process computer (HPC)
Konputazio-klusterrak ezaugarri hauek ditu:
- X430 A6 kudeaketa-nodo 1. AMD Turin 9655 prozesadore 1, 96 nukleorekin, 2,6 GHz-tan. 128 GB RAM eta bi 0,96 TB SSD.
- 3 Thin Bull Sequana X440 A6 konputazio-nodo. Bakoitza bi AMD Turin 9655 prozesadorerekin, 96 nukleorekin, 2,6 GHz-tan. 1152 GB RAM (6 GB nukleo bakoitzeko) eta bi 0,96 TB SSD.
- 2 Fat Bull Sequana X430 A6 konputazio-nodo. Bakoitza AMD Turin 9655 prozesadore batekin, 96 nukleorekin, 2,6 GHz-tan. 1152 GB RAM (12 GB nukleo bakoitzeko) eta bi 0,96 TB SSD.
- Bull Sequana X450 A6 GPU konputazio-nodo 1. Nvidia L40S 1. AMD Turin 9655 prozesadore 1, 96 nukleorekin 2,6 GHz-tan. 1152 GB RAM (6 GB nukleo bakoitzeko) eta bi 0,96 TB SSD.
- Errendimendu handiko biltegiratze sistema, 830 TB-ko edukiera garbiarekin Beegfs motako scratch-ean. Biltegiratze zerbitzariak bi Bull Sequana X430 A6 dira, bakoitza AMD Turin 9655 prozesadore bana duena, 96 nukleorekin 2,6 GHz-tan. 128 GB RAM eta bi 0,96 TB SSD.
- 220 TB-ko biltegiratze sistema hotza.
Informazio gehiago

Tarifak
Harremanetarako formularioak
Plataformako kideak
-
Iván Revuelta Antizar
Informatika eta Informazio Sistemen Unitateko burua
ivan.revueltaantizar@osakidetza.eus
842552 | 946182633
Bio 1 | Gurutzeta, Bizkaia
-
Manuel Blanes Rodríguez
Bioinformatika Unitateko burua
manuel.blanesrodriguez@bio-bizkaia.eus
849081 | 946182634
Bio 1 | Gurutzeta, Bizkaia
-
Borja Santos Zorrozua
Bioestatistika Unitatea
borja.santoszorrozua@bio-bizkaia.eus
846172 | 946006172
Bio 1 | Gurutzeta, Bizkaia
-
Silvia Pérez Fernández
Bioestatistika Unitatea
silvia.perezfernandez@bio-bizkaia.eus
842367 | 946182636
Bio 1 | Gurutzeta, Bizkaia
-
Imanol González Barcina
Informatika eta Informazio Sistemen Unitatea
imanol.gonzalezbarcina@bio-bizkaia.eus
842546 | 946182634
Bio 1 | Gurutzeta, Bizkaia
-
Aitor Zarandona Garai
Bioinformatika Unitatea
aitor.zarandonagarai@bio-bizkaia.eus
849081
Bio 1 | Gurutzeta, Bizkaia
-
Edurne Arteta Bilbao
Informatika eta Informazio Sistemen Unitatea
edurne.artetabilbao@bio-bizkaia.eus
841872 | 944526872
Bio 1 | Gurutzeta, Bizkaia
-
Álvaro Martín Núñez
Informatika eta Informazio Sistemen Unitatea
alvaro.martinnunez@bio-bizkaia.eus
841764 | 944526764
Bio 1 | Gurutzeta, Bizkaia

